Τον Ιανουάριο του 2006, η Διεθνής Δύναμη Ασφαλείας (ISAF) αναπτύχθηκε στο Αφγανιστάν για να βοηθήσει τον στρατό των ΗΠΑ και του Ηνωμένου Βασιλείου στον αγώνα κατά των ισλαμιστών παραστρατιωτικών Ταλιμπάν. Η κυβέρνηση των ΗΠΑ κατηγόρησε τους Ταλιμπάν ότι φιλοξένησε τον επικεφαλής της Αλ Κάιντα, τον Οσάμα Μπιν Λάντεν, και ζήτησε την έκδοσή του. Η ηγεσία των Ταλιμπάν αρνήθηκε να συμμορφωθεί με αυτό το αίτημα, λέγοντας ότι οι Ηνωμένες Πολιτείες δεν παρείχαν αποδεικτικά στοιχεία για την ενοχή του Οσάμα στις επιθέσεις της 9/11/2001.
Μέχρι το τέλος του 2001, η στρατιωτική δομή των Ταλιμπάν καταστράφηκε ουσιαστικά και η αντίσταση των υποστηρικτών της έλαβε τη μορφή ενός ανταρτικού κινήματος. Οι δυτικές χώρες έχουν επενδύσει σημαντικά στην ανάπτυξη της δημοκρατίας και της κοινωνικής δομής του Αφγανιστάν. Το 2004, οι πρώτες προεδρικές εκλογές της χώρας κέρδισαν ο Χαμίντ Καρζάι, πολιτικός που είναι αρκετά πιστός στη Δύση. Ωστόσο, η αντίσταση των υποστηρικτών των Ταλιμπάν απέτυχε να κατασταλεί. Οι αντάρτες πολέμησαν σκληρά παρά την τεράστια στρατιωτική υπεροχή της ISAF.
Η Γαλλία, όπως και άλλα μέλη της συμμαχίας, υπέστη απώλειες εξοπλισμού και εργατικού δυναμικού. Κατά τη διάρκεια των 10 ετών του πολέμου στο Αφγανιστάν, 83 στρατιώτες σκοτώθηκαν και αρκετές φορές τραυματίστηκαν. Η απόφαση συμμετοχής της Γαλλίας στη στρατιωτική επιχείρηση δεν ήταν πολύ δημοφιλής στον πληθυσμό και οι αναφορές για απώλειες μεταξύ Γάλλων στρατιωτών αύξησαν τη δυσαρέσκεια με την κυβέρνηση.
Στις 20 Ιανουαρίου 2012, στην επαρχία Kapisa, ένας άνδρας με στολή αφγανικού στρατού πυροβόλησε 4 και τραυματίστηκε 16 Γάλλοι στρατιώτες. Μετά από αυτό, ο Νικολά Σαρκοζί (Γάλλος Πρόεδρος από το 2007 έως το 2012) είπε ότι επειδή η αφγανική κυβέρνηση δεν μπορεί να εγγυηθεί την ασφάλεια των γαλλικών στρατευμάτων, η Γαλλία αναστέλλει τη στρατιωτική της παρουσία στη χώρα αυτή. Ο Σαρκοζί υποσχέθηκε να αποσύρει στρατεύματα από το Αφγανιστάν μέχρι τις αρχές του 2014.
Το 2012, ο François Hollande εξελέγη Πρόεδρος της Γαλλίας, ο οποίος ανακοίνωσε ένα νέο σχέδιο αποχώρησης από το Αφγανιστάν. 2.000 στρατιώτες θα αποσυρθούν έως το τέλος του 2012, 1.400 παραμένουν ως εκπαιδευτές και θα φρουρούν τις κοινωνικές εγκαταστάσεις. Ο Πρόεδρος εξήγησε την απόφασή του από το γεγονός ότι ο κίνδυνος από τους τρομοκράτες έχει μειωθεί, η δημοκρατία έχει ενισχυθεί και η χώρα πρέπει να αναπτυχθεί ανεξάρτητα. Ο αρχηγός της δημοκρατίας υποσχέθηκε ότι η Γαλλία θα συνεχίσει να υποστηρίζει το Αφγανιστάν, αλλά με διαφορετική μορφή.
